Hidrografska djelatnost obuhvaća hidrografsku izmjeru mora, geodetska i druga snimanja objekata u priobalju, moru, morskom dnu i podmorju. "Geodezija d.o.o. Šibenik" obavlja širok spektar hidrografskih usluga, od hidrografskog snimka, iskolčenja i kontrole podvodnih objekata, do izrade različitih hidrografskih izvješća.
Hidrografski snimci namijenjeni su projektiranju, praćenju i kontroli terestričkih i hidrografskih mjerenja u priobalju, moru, na morskom dnu i podmorju. Hidrografski snimak služi projektantu, investitoru ili izvodaču radova kao izvor informacija pomoću kojeg dobivaju uvid u stanje na terenu prije, za vrijeme i nakon završetka radova.Za hidrografska mjerenja "Geodezija Šibenik" d.o.o. koristi ehosonder VALEPORT MIDAS opremljen dvofrekventnom sondom i DGPS sustavom za određivanje položaja. U praksi se često hidrografska mjerenja kombiniraju s terestričkim mjerenjima obalnog pojasa.
Pri obradi hidrografskih mjerenja koristimo velik broj vlastitih aplikacija za navigaciju, obradu i transformaciju.
